故事剧情为电视动画的前传，3rei系列中卫宫士郎和美游两兄妹的故事，"平行世界"中卫宫士郎与朔月美游初次相遇，美游的成长经历和真实身份揭晓，面对朱利安对美游的"圣杯"觊觎而将其虏走，士郎不敌下濒死重伤，被神父绮礼所救后获知朱利安的目的。在间桐樱付出生命下，士郎利用阶级卡化身英灵的赝品，再度闯进恩兹华斯家展开激战，誓要夺回美游。最终向圣杯许愿让美游获得幸福，从而让美游穿越到了伊莉雅所在的世界，并与伊莉雅成为了朋友，成为了《魔法少女☆伊莉雅》故事的开端。
